بدأ مشروع قرآن فلاش في فبراير 2007 كموقع بسيط يعرض القرآن الكريم (مصحف المدينة) بطريقة تفاعلية سلسة، وقد استغرق هذا المشروع ما يقارب شهرين من العمل لإنحازه من قبل بعض الشباب المتطوعين، حيث طورت فكرة الموقع من خلال مشروع قد قام به نفس أعضاء الفريق وهو Flash-eBook.com, والذي تطوّر مع الوقت ليصبح برنامج لإنشاء كتب ومجلات إلكترونية تفاعلية ومكتبات وأرفف إلكترونية لأجهزة الآندرويد والآي باد والإنترنت بإسم كتبي. وكان قرآن فلاش مبدئياً مجرد نموذج بياني لهذه الخدمة الحديثة.